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Première publication : 06/06/2012 - Dernière mise à jour : 22/10/2012
Contribution réalisée par : Paul PILLOT

Complexe entre la conotoxine alpha ImI et un récepteur à l'acétylcholine, l'AchBP

Références

Auteurs : Hansen, S.B., Sulzenbacher, G., Huxford, T., Marchot, P., Taylor, P., Bourne, Y.
Publication :
"CRYSTAL STRUCTURE OF APLYSIA CALIFORNICA ACHBP IN COMPLEX WITH ALPHA-CONOTOXIN IMI" in The EMBO journal 2005 nº24 pages 3635-46 PubMed

Source : PDB Identifiant : 2byp

Classification

Organisme d'origine : Conus imperialis
Catégorie :
organique > protide > protéine > récepteur > neurotransmetteur > Complexe entre la conotoxine alpha ImI et un récepteur à l'acétylcholine, l'AchBP
organique > protide > protéine > toxine > Complexe entre la conotoxine alpha ImI et un récepteur à l'acétylcholine, l'AchBP

Description

Ce modèle présente un complexe entre une neurotoxine produite par un cône (mollusque prédateur), la conotoxine et l'AchBP. Cette dernière est une protéine homologue à la partie extracellulaire du récepteur nicotinique. Elle est utilisée comme modèle pour étudier la fixation de différents ligands.

Dans ce modèle, l'AchBP se présente sous la forme d'une molécule constituée de cinq chaînes identiques (homopentamère), identifiées A à E.
Cinq molécules de conotoxines sont fixées sur ces chaînes de l'AchBP au niveau des sites de liaison de l'acétylcholine (chaînes F à J).

complexe entre achbp et conotoxineFigure 1 : les 5 chaînes de l'AchBP en vue polaire, affichées en "spaghetti". Les molécules de conotoxine sont en sphères

 

Les molécules de conotoxine sont des peptides courts (12 acides aminés). Celles-ci ont une grande sélectivité pour certains récepteurs : actives sur les muscles de grenouille, elles ne sont actives que sur les récepteurs du systène nervaux central des mammifères.Sur le complexe présenté ici, elles augmentent l'ouverture du domaine de fixation à l'acétylcholine.

vue du complexe entre une chaîne d'achbp et une molécule de conotoxineFigure 2 : détail du complexe. La chaîne d'AchBP est affichée en "spaghetti". L'ouverture du site de fixation à l'acétylcholine peut être visualisée par les acides aminés Trp147 et Cys 190 repérés en jaune. La conotoxine α est en sphères

 

La conotoxine a une action inhibitrice (antagoniste) sur le récepteur nicotinique. On peut supposer qu'en maintenant le domaine de fixation en configuration ouverte, elle bloque le changement de conformation de la partie transmembranaire du récepteur, empêchant la transmission du signal nerveux.

Visualisation en ligne

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    Séquences des molécules présentes dans le modèle
    Chaîne Séquence
    Phylogène
    Anagène
    A
    DDDDKLHSQANLMRLKSDLFNRSPMYPGPTKDDPLTVTLGFTLQDIV...
    B
    DDDDKLHSQANLMRLKSDLFNRSPMYPGPTKDDPLTVTLGFTLQDIV...
    C
    DDDDKLHSQANLMRLKSDLFNRSPMYPGPTKDDPLTVTLGFTLQDIV...
    D
    DDDDKLHSQANLMRLKSDLFNRSPMYPGPTKDDPLTVTLGFTLQDIV...
    E
    DDDDKLHSQANLMRLKSDLFNRSPMYPGPTKDDPLTVTLGFTLQDIV...
    F
    GCCSDPRCAWRX
    G
    GCCSDPRCAWRX
    H
    GCCSDPRCAWRX
    I
    GCCSDPRCAWRX
    J
    GCCSDPRCAWRX
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