Références
Auteurs : R.E. Stenkamp, S. Filipek, C.A.G.G. Driessen, D.C. Teller, K. Palczewski
Source : PDB (théorique)
Détails
: 1KPX
Classification
Organisme d'origine : Homme
Catégorie :
organique >
protide >
protéine >
récepteur >
photorécepteur >
Opsine sensible au rouge (modèle théorique)
Description
Modèle théorique de l'opsine verte humaine, obtenu en utilisant le modèle de rhodopsine bovine comme trame. Les deux séquences ont 38% d'homologie. Voir l'article concernant le modèle de l'opsine bleue humaine pour les informations concernant la structure des opsines en général.
La partie transmembranaire des opsines et de la rhodopsine ne diffère pas par des insertions ou des délétions. Par contre les opsines "rouge" et "verte" comportent une boucle supplémentaire de 10 acides aminés.
À proximité du rétinal, l'acide glutamique (Glu102) est responsable de la présence d'une charge négative supplémentaire qui expliquerait le décalage vers le rouge du maximum d'absorption de ces opsines par rapport à la rhodopsine.
Figure 1 : Environnement du rétinal. Les acides glutamiques porteurs de charges sont indiqué en rouge.Visualisation en ligne
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